Om de effectiviteit van SterkWerk te kunnen onderzoeken worden deelnemende school onderdeel van een gerandomiseerd onderzoek met controlegroep. Dit betekent dat wij scholen die het programma gebruiken (interventiescholen) zullen vergelijken met scholen die het programma niet uitvoeren (controlescholen). Zowel kinderen op interventiescholen als op controlescholen vullen vragenlijsten in. Op deze manier kunnen resultaten worden vergeleken. Een school wordt willekeurig gekozen als interventie- of als controleschool. De onderzoekers hebben geen invloed op dit proces. Interventiescholen starten in september 2019 met het programma SterkWerk. Controlescholen komen op een wachtlijst om in september 2020 te starten. Voor beide soorten scholen zijn er geen kosten verbonden aan deelname.
Het onderzoek naar SterkWerk richt zich op de onderlinge relaties in de groep. Er zal worden onderzocht of prosociaal gedrag in de klas toeneemt, of de verbondenheid met school versterkt en of het pesten in de klas afneemt. Antisociaal gedrag zoals pesten, kan voortkomen uit de behoefte aan status of populariteit. SterkWerk geeft kinderen positieve manieren om hun behoefte aan status te vervullen. Het is de bedoeling dat er een omgeving wordt gecreëerd waarin veel ruimte is voor positief gedrag dat openlijk wordt beloond met complimenten en aandacht. Zo hopen we dat kinderen antisociaal gedrag inruilen voor prosociaal gedrag.